中国医学科学院药物研究所设施资源图书资源根据2019年3月图书馆官网显示，中国医学科学院图书馆拥有各类印刷型文献总量累计275万册, 尤以外文医学期刊较为丰富；每年订购印刷型中外文现刊4600余种，各类数据库80余个，其中包括中外文电子期刊12000余种，电子图书约14万种，以及医学领域重要文摘型、引文型、事实工具型数据库如Embase、SCIE、Uptodate、F1000等40余种，基本涵盖预防医学、基础医学、临床医学和药学领域常用的学术信息资源

 设备设施根据2019年3月研究所官网显示，天然药物活性物质与功能国家重点实验室同时拥有包括核磁共振、质谱仪、液相色谱仪、X衍射仪等先进仪器设备200余台，价值1亿余元

 国家药物及代谢产物分析研究中心拥有与国际接轨的药学分析大中型先进仪器及设备70余台，包括：600兆核磁共振仪和LC-MS-NMR联用仪、高分辨串联质谱仪、冷喷雾质谱仪、HPLC-MS/MS联用仪、GC-MS联用仪、单晶X射线衍射仪、粉末X射线衍射仪、X射线荧光元素分析、高分辨拉曼光谱仪、傅立叶红外光谱仪、微量元素分析仪、高效液相色谱仪、气相色谱仪、紫外可见分光光度计、旋光分析仪、原子吸收分光光度计、原子荧光分光光度计查实扫描量热仪、热重分析仪、激光粒度分析仪、氨基酸分析仪、溶出仪、崩解仪、电位滴定仪等

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