京都国际漫画博物馆馆藏文物博物馆主要搜集、保管、展示备受注目和读者欢迎的漫画作品，进行动漫文化的调查、研究以及拓展和策划动漫文化活动等
该馆开馆时总藏书共20万本，目标是成为世界最大的漫画资料收藏馆
博物馆收藏的漫画作品、杂志及海内外各类珍贵历史资料多达数十万件，漫画藏书量可以说是日本第一
其中收藏的珍贵漫画包括日本最初的儿童漫画杂志《少年PACK》和战争期间的杂志《漫画之国》等
馆内陈列的漫画，也反映了不同时代的面貌
二战期间，日本写了不少以战场为故事背景的漫画
到了日本漫画全盛期的1995年，所撰写的《龙珠》连环杂志，每周可销售648万本
收藏品则由日本漫画始祖、1874年发表的《漫画新闻日本》、日本首本以及美国版的《少年JUMP》、《多啦A梦》在亚洲的各个译本至美国的超人漫画及各种同人志均一应俱全，而在珍藏馆内，连香港的《龙虎门》、《中华英雄》等都给珍而重之地摆放起来
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