周自齐逆势而动，复辟帮凶尽管周自齐做过不少爱国利民的好事，但在历史的大变革中，他基本上站在反动保守的立场上，对新兴的革命势力持反对态度

1912年，周自齐调任山东都督兼民政长，期间极力反对日益发展的革命势力

他曾在单县一带组织团丁500名，发放枪支，对付民众的反抗；在鲁南韩庄一带设防，抵御革命军北进

他督鲁时期，虽然在政治上表现出了一点“民主”，但总体上是腐败的

他在山东任职不到一年半，便积蓄了万贯家财；调离济南回北京时，还私提现款12万元据为己有

1914年12月23日，他参加了袁世凯在天坛导演的“祭天典礼”丑制

1916年6月袁世凯死后，周自齐被列为帝制祸首之一，被黎元洪通缉

但因消息走漏，周幸运地流亡日本

1918年2月，冯国璋代理总统，取消了对周自齐等人的通缉令

周才结束流亡生涯，从日本回国

 周自齐获特赦后，又继续在北洋政府的几届内阁中担任要职

1922年4月，他被大总统徐世昌任命为代理内阁总理兼教育总长，因徐世昌下台还代理了10天的大总统职务

大总统黎元洪复职后，周当了财政整理委员会的挂名职务

回国后筹办了孔雀电影制片公司

1923年10月，他在上海病故，移葬于北京西门头沟的九龙山

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