安徽农业大学科研机构截至2018年3月，学校现有1个国家重点实验室、1个国家地方联合工程实验室、1个国际合作联合实验室、1个国家国际科技合作基地、1个教育部、科技部“高等学校学科创新引智计划”基地、1个国家技术转移中心、61个省部级科研平台、2个省级“2011协同创新中心”、1个安徽省重点智库、1个安徽省高校智库、1个安徽省科技创新智库、1个省级产业共性技术研究院，9个省“115”产业创新团队，7个省级高校科研平台创新团队，7位国家现代农业产业技术体系岗位科学家、8位安徽省现代农业产业技术体系首席科学家

 近三年获国家科技进步奖2项，主持获省部级科技奖42项，其中一等奖4项；省级以上动植物新品种69个；申请发明专利747项、授权323项

主持国家重点研发计划项目3项、课题25项，国家基金154项

国家级科研机构：国家级科研机构名称等级批准部门类型省部共建茶树生物学与资源利用国家重点实验室国家级科技部国家重点实验室作物抗逆育种与减灾国家地方联合工程实验室国家级国家发改委国家地方联合工程实验室安徽农业大学国家技术转移中心国家级科技部国家技术转移示范机构农林科学技术与生物资源开发国际科技合作基地国家级科技部国家国际科技合作基地高等学校新农村发展研究院国家级科技部、教育部研究院国家部委科研机构：国家部委科研机构名称等级批准部门类型教育部茶叶化学与健康国际合作联合实验室部级教育部国际合作联合实验室自然资源部江淮耕地资源保护与生态修复重点实验室部级自然资源部自然资源部重点实验室 茶树生物学与品质化学学科创新引智基地部级教育部、科技部“111计划”引智基地国家农业科技创新与集成示范基地部级农业部农业部研究基地真菌生物技术教育部工程研究中心部级教育部教育部工程研究中心教育部大别山区农林特色产业省部共建协同创新中心部级教育部省部共建协同创新中心教育部安徽省粮食作物省部共建协同创新中心部级教育部省部共建协同创新中心教育部茶叶生物化学与生物技术重点实验室部级教育部教育部重点实验室农业部农业物联网技术集成与应用重点实验室部级农业部农业部重点实验室农业部农业传感器重点实验室部级农业部农业部重点实验室农业部江淮农产品精深加工与资源利用重点实验室部级农业部农业部重点实验室农业部农业电子商务重点实验室部级农业部农业部重点实验室农业部茶树生物学与茶叶加工重点实验室部级农业部农业部重点实验室农业部农产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室（合肥）部级农业部农业部重点实验室农业部黄淮南部小麦生物学与遗传育种重点实验室部级农业部农业部重点实验室林木材质改良与高效利用国家林业局重点实验室部级国家林业局国家林业局重点实验室合肥城市生态系统国家定位观测研究站部级国家林业局国家陆地生态系统定位观测研究站国家农产品加工技术研发茶叶加工专业分中心部级农业部农业部研发中心农业部小麦区域创新研究中心部级农业部农业部研究中心农业部全国农业农村信息化示范基地部级农业部农业部研究基地农业部茶加工技术集成科研基地部级农业部农业部研究基地农业部合肥农业环境科学观测实验站部级农业部农业部科学观测实验站农业部华东地区作物栽培科学观测实验站部级农业部农业部科学观测实验站农业部南方农业装备科学观测实验站部级农业部农业部科学观测实验站植物病虫害生物学国家重点实验室合肥研究中心部级科技部国家重点实验室研究中心国家中原山地特色园艺作物种质资源圃部级农业部国家种质资源圃国家植保微生物种质资源库（安徽）部级农业部国家种质资源圃省级科研机构：省级科研机构名称等级批准部门类型安徽省茶叶生物化学与生物技术重点实验室省级安徽省科技厅安徽省重点实验室安徽省作物生物学重点实验室省级安徽省科技厅安徽省重点实验室安徽省微生物防治重点实验室省级安徽省科技厅安徽省重点实验室作物有害生物综合治理安徽省重点实验室省级安徽省科技厅安徽省重点实验室兽医病理生物学与疫病防控安徽省重点实验室省级安徽省科技厅安徽省重点实验室农田生态保育与污染防控安徽省重点实验室省级安徽省科技厅安徽省重点实验室智慧农业技术与装备安徽省重点实验室省级安徽省科技厅安徽省重点实验室生物质材料与能源安徽省重点实验室省级安徽省教育厅安徽省重点实验室农产品质量安全安徽省重点实验室省级安徽省科技厅安徽省重点实验室安徽省农业信息学重点实验室省级安徽省教育厅安徽省重点实验室植物病虫害生物学与绿色防控安徽省重点实验室省级安徽省教育厅安徽省重点实验室地方特色植物资源开发与利用安徽省工程技术研究中心省级安徽省教育厅安徽省工程技术研究中心安徽省玉米工程技术研究中心省级安徽省科技厅安徽省工程技术研究中心小麦产业安徽省工程技术研究中心省级安徽省教育厅安徽省工程技术研究中心安徽省重地方禽畜遗传资源保护与生物育种点实验室省级安徽省科技厅安徽省重点实验室人畜共患病安徽省重点实验室省级安徽省教育厅安徽省重点实验室木材科学与技术安徽省重点实验室省级安徽省教育厅安徽省重点实验室安徽省生物育种工程实验室省级安徽省发改委安徽省工程实验室安徽省农产品加工工程实验室省级安徽省发改委安徽省工程实验室安徽省智能农机装备工程实验室省级安徽省发改委安徽省工程实验室安徽省北斗精准农业信息工程实验室省级安徽省发改委安徽省工程实验室安徽省绿色农药研发与应用工程实验室省级安徽省发改委安徽省工程实验室安徽省动物性食品质量与生物安全工程实验室省级安徽省发改委安徽省工程实验室安徽省健康睡眠家居产品工程研究中心 省级安徽省发改委安徽省工程实验室安徽省绿色磷肥智能制造与高效利用工程研究中心省级安徽省发改委安徽省工程研究中心安徽省高性能生物基尼龙工程研究中心省级安徽省发改委安徽省工程研究中心安徽省园艺作物育种工程实验室省级安徽省发改委安徽省工程实验室安徽省蚕桑资源利用国际联合研究中心省级安徽省科技厅安徽省国际联合研究中心安徽省园艺产品品质与采后生物技术“一带一路”国际联合研究中心省级安徽省科技厅安徽省国际联合研究中心农业生物产品与生产环境安全检测安徽科技创新公共服务平台省级安徽省科技厅安徽省科技服务平台绿色食品全产业链融合安徽省哲学社会科学重点实验室省级安徽省教育厅安徽省哲学社会科学重点实验室安徽现代农业发展研究中心省级安徽省教育厅安徽省高校智库安徽农业现代化研究院省级安徽省委宣传部安徽省重点智库安徽省农业领域科技创新综合智库省级安徽省科技厅安徽省科技创新智库安徽农业大学农科教结合研究中心省级安徽省教育厅安徽省重点人文社科研究基地皖江农产品加工研究院省级安徽省科技厅省级研究院安徽畜禽产业共性技术研究院省级安徽省教育厅省级产业共性技术研究院  

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