徐州市农业科学院改革开放1978年起，研究所落实知识分子政策，彻底平反冤假错案，任用科技人员担任党、政领导职务，成立所务委员会、学术委员会，建立新的管理系统和组织结构，建立成果评奖和职称评定制度

1979年5月，徐州地区农业科学研究所升格为一级局，为徐州地区行署

1983年3月，徐州地区农业科学研究所更名为徐州市农业科学研究所（地，市合并），属于徐州市政府；5月，更名为江苏徐淮地区农业科学研究所，隶属于江苏省农科院；11月，更名为江苏徐淮地区徐州农业科学研究所

1984年3月，研究所增挂江苏徐州甘薯研究室牌子

1981年～2009年，研究所共接待30多个国家或地区以及国际科研开发机构116批301人次来访，出访65批93人次，与国际马铃薯中心、亚洲蔬菜发展与研究中心和其他境外相关机构建立多项合作，聘请7名境外专家任特约研究员

1989年8月，江苏徐州甘薯研究室改称江苏徐州甘薯研究中心

1991年1月，增挂徐州市农业科学研究所牌子

1999年11月，农业部在研究所设立国家甘薯研究中心；12，徐州市农业科学研究所改称徐州市农业科学院

2002年11月，徐州市农业科学院增挂中国农业科学院甘薯研究所

 2013年，铜山试验站“人、财、物”由省农科院全部移交给江苏徐淮地区徐州农科所管

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