中国农业科学院柑桔研究所科研成果截至2016年9月，中国农业科学院柑桔研究所先后获得各项研究成果150余项（其中国家级奖励成果10项，部省级奖励成果51项），专利10项；2001年至2016年9月，获得科研成果12项，申请专利6项，新品种审定5个，制（修）订国家和行业标准15项；编著和参加编著科技著作100余部，发表论文1800余篇（2001年至2005年，发表论文341篇，出版专著14部）
所获得的主要国家级成果奖有：国家发明三等奖1项：中育7号甜橙育成与应用；国家科技进步二等奖2项：国家果树种质圃的建立、果树资源性状鉴定及优化种质筛选；国家科技进步三等奖2项：哈姆林甜橙的引种及推广、国外果树引种试种研究与利用；全国、省、市科学大会奖3项：柑桔罐藏品种研究、应用抗生素防治柑桔黄龙病、云南红河橙—柑桔属大翼橙亚属的一个新种
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