中国热带农业科学院南亚热带作物研究所研究方向南亚所是农业农村部直属单位，是我国最早从事南亚热带作物研究的科研机构之一，主要以菠萝、芒果、澳洲坚果等南亚热带果树，剑麻和甘蔗等热带纤维和糖料作物等南亚热带作物为研究对象，开展种质资源与遗传育种、作物栽培、采后贮运与保鲜、农业资源高效利用与良好环境生态建设等基础、应用基础和共性关键技术研究

全所下设15个科研机构，分别为南亚热带作物种质资源研究室、植物营养研究室、休闲农业研究室、园艺产品保鲜与加工研究室、旱作新材料研究室、旱作农业工程技术研究中心、旱作种业与节水研究中心、南亚热带粮食作物研究中心、香蕉杂交育种研究中心、剑麻研究中心、菠萝研究中心、澳洲坚果研究中心、芒果研究中心、荔枝龙眼研究中心、南方蔬菜研究中心

4个管理机构，分别为办公室、科技处、财务处、条件保障处

服务机构有产业发展部、四川攀枝花研究院综合办公室、广西百色综合实验站、湛江市热农农业科技发展公司（所办企业），其中产业发展部下设乡村振兴服务中心、良种苗木繁育中心、农业试验材料生产中心、南亚热带植物园科普中心、后勤服务中心、基地服务中心、院大仪中心南亚所分中心 

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