中国热带农业科学院热带生物技术研究所科研成果截至2017年11月，研究所先后承担973计划、863计划、国家自然基金、支撑计划、公益性行业科研专项、基础性工作专项以及国际合作项目等各级各类项目500多项，荣获省部级科技奖励62项，授权专利133件，发表科技论文2700多篇；出版专著36部

研究所完成了木薯野生祖先种和栽培种2个全基因组测序，提出木薯碳硫分配和块根淀粉高效积累模型，创建基因组序列草图，为全球木薯育种从表型选择走向基因组选择奠定基础

研究所建立了甘蔗高效遗传转化体系，获得300多个抗旱/病/虫和调节糖分积累的甘蔗株系；培育的甘蔗健康种苗可提高产量20%以上、提高蔗糖分0.5%-1%，节约用种量60%；建立了香蕉高效遗传转化体系，完成了BB型香蕉的全基因组深度测序，初步揭示了香蕉重要性状关联的基因变异、关键途径、转录调控网络

研究所系统调查和整理了黎药资源，完成了《黎族药志》的编写，对沉香、见血封喉、海南血竭、海南黄花梨等35种特色黎药的活性天然产物进行了研究，研发沉香系列护肤品、益智酒、高良姜茶、海蜜胶囊等48种黎（南）药系列功能性新产品

研究所首次揭示了蛋白翻译后修饰在乙烯促进天然橡胶合成过程中的新调控机制，对如何提高巴西橡胶树胶乳产量提供了新的理论基础；首次构建了木薯块根膨大过程中参与碳代谢和淀粉积累途径的蛋白调控模式图，为培育高淀粉木薯品种提供新的理论依据和研究方向 

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