王星拱自然科学方面作为自然科学家，他有着自发的自然科学的唯物主义和辩证法思想；作为哲学家，他又深受第二代实证主义代表人物马赫的影响，在20世纪20年代的“科玄之争”中，站在“科学派”一边，反对“玄学派”，同时也与马克思主义的辩证唯物论相对立
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