中国农业科学院蚕业研究所研究部门据2017年11月研究所官网显示，研究所设有3个国家级平台、1个农业部重点实验室、1个农业部质检中心、1个农业部野外观测站、2个农业部研究室、1个江苏省基因库、1个中国农业科学院重点实验室、3个研究室、2个挂靠单位
国家级平台：国家蚕桑育种中心、国家蚕种质资源保存中心、国家桑树种质资源圃农业部重点实验室：农业部蚕桑遗传改良重点实验室农业部质检中心：农业部蚕桑产业产品质量监督检验测试中心农业部野外观测站：农业部镇江桑树资源重点野外科学观测试验站农业部研究室：农业部病虫害防控功能研究室、农业部养蚕与桑树栽培功能研究室江苏省基因库：江苏省蚕种质资源基因库中国农业科学院重点实验室：中国农业科学院蚕桑遗传改良重点实验室 研究所研究室：栽桑研究室、养蚕育种室、蚕病生理室挂靠单位：中国蚕学会、全国蚕桑品种审定委员会
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