中国农业科学院棉花研究所科研部门据2018年8月研究所官网显示,中国农业科学院棉花研究所建有国家重点实验室1个,省部级重点实验室2个,此外建有农业部棉花品质监督检验测试中心、农业部转基因植物环境安全监督检验测试中心、国家棉花改良中心、国家转基因棉花中试基地,使研究所成为国家棉花科技原始创新中心,为组织全国棉花科技创新工作搭建了技术平台
国家重点实验室:棉花生物学国家重点实验室 国家级科研平台:国家棉花种质资源圃、国家棉花种质中期库、国家棉花改良中心 农业部级科研平台:农业部棉花品质监督检验测试中心、农业部转基因植物环境安全监督检验测试中心(安阳)、农业部棉花生物学与遗传育种重点实验室 河南省级重点实验室:河南省棉花生物学重点实验室
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